Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EGFRP00533 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EGFRP00533 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
EGFRP00533 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EGFRP00533 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EGFRP00533 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EGFRP00533 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EGFRP00533 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EGFRP00533 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EGFRP00533 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EGFRP00533 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EGFRP00533 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EGFRP00533 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EGFRP00533 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EGFRP00533 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EGFRP00533 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EGFRP00533 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EGFRP00533 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EGFRP00533 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EGFRP00533 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EGFRP00533 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EGFRP00533 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EGFRP00533 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EGFRP00533 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EGFRP00533 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EGFRP00533 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EGFRP00533 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EGFRP00533 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EGFRP00533 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EGFRP00533 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EGFRP00533 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EGFRP00533 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EGFRP00533 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EGFRP00533 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EGFRP00533 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EGFRP00533 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EGFRP00533 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EGFRP00533 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EGFRP00533 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EGFRP00533 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EGFRP00533 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EGFRP00533 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EGFRP00533 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EGFRP00533 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EGFRP00533 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EGFRP00533 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EGFRP00533 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EGFRP00533 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EGFRP00533 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EGFRP00533 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EGFRP00533 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EGFRP00533 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EGFRP00533 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EGFRP00533 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EGFRP00533 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EGFRP00533 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EGFRP00533 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EGFRP00533 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EGFRP00533 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EGFRP00533 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EGFRP00533 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EGFRP00533 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EGFRP00533 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EGFRP00533 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EGFRP00533 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EGFRP00533 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EGFRP00533 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EGFRP00533 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EGFRP00533 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EGFRP00533 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EGFRP00533 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EGFRP00533 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EGFRP00533 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EGFRP00533 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
EGFRP00533 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EGFRP00533 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EGFRP00533 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EGFRP00533 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EGFRP00533 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
EGFRP00533 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EGFRP00533 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EGFRP00533 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EGFRP00533 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EGFRP00533 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EGFRP00533 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EGFRP00533 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EGFRP00533 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EGFRP00533 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EGFRP00533 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EGFRP00533 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EGFRP00533 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EGFRP00533 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EGFRP00533 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EGFRP00533 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EGFRP00533 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EGFRP00533 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EGFRP00533 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EGFRP00533 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EGFRP00533 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EGFRP00533 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms