Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUDT3O95989 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUDT3O95989 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms