Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA4FO95754 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4FO95754 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms