Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATE1O95260 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATE1O95260 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATE1O95260 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATE1O95260 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATE1O95260 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATE1O95260 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATE1O95260 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATE1O95260 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATE1O95260 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATE1O95260 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATE1O95260 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATE1O95260 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATE1O95260 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATE1O95260 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATE1O95260 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATE1O95260 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATE1O95260 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATE1O95260 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATE1O95260 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATE1O95260 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATE1O95260 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATE1O95260 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATE1O95260 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATE1O95260 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATE1O95260 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATE1O95260 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATE1O95260 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATE1O95260 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATE1O95260 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATE1O95260 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATE1O95260 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATE1O95260 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATE1O95260 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATE1O95260 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATE1O95260 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATE1O95260 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATE1O95260 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATE1O95260 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATE1O95260 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATE1O95260 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATE1O95260 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATE1O95260 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATE1O95260 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATE1O95260 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATE1O95260 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATE1O95260 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATE1O95260 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATE1O95260 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATE1O95260 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATE1O95260 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATE1O95260 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATE1O95260 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATE1O95260 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATE1O95260 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATE1O95260 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATE1O95260 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATE1O95260 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATE1O95260 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATE1O95260 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATE1O95260 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATE1O95260 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATE1O95260 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATE1O95260 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATE1O95260 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATE1O95260 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATE1O95260 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATE1O95260 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATE1O95260 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATE1O95260 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATE1O95260 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATE1O95260 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATE1O95260 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATE1O95260 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATE1O95260 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATE1O95260 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATE1O95260 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATE1O95260 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATE1O95260 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATE1O95260 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATE1O95260 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATE1O95260 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATE1O95260 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATE1O95260 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATE1O95260 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATE1O95260 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATE1O95260 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATE1O95260 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATE1O95260 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATE1O95260 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATE1O95260 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATE1O95260 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATE1O95260 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATE1O95260 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATE1O95260 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATE1O95260 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATE1O95260 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATE1O95260 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATE1O95260 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATE1O95260 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms