Protein–RNA interactions for Protein: O95259

KCNH1, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 1, humanhuman

Predictions only

Length 989 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH1O95259 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH1O95259 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH1O95259 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms