Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LETM1O95202 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM1O95202 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM1O95202 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM1O95202 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM1O95202 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM1O95202 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM1O95202 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM1O95202 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM1O95202 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM1O95202 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM1O95202 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LETM1O95202 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LETM1O95202 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM1O95202 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM1O95202 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM1O95202 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM1O95202 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM1O95202 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM1O95202 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM1O95202 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM1O95202 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM1O95202 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LETM1O95202 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LETM1O95202 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LETM1O95202 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LETM1O95202 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LETM1O95202 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LETM1O95202 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LETM1O95202 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LETM1O95202 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LETM1O95202 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LETM1O95202 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LETM1O95202 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LETM1O95202 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LETM1O95202 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LETM1O95202 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LETM1O95202 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LETM1O95202 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM1O95202 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM1O95202 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM1O95202 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM1O95202 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM1O95202 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM1O95202 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM1O95202 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LETM1O95202 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LETM1O95202 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LETM1O95202 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LETM1O95202 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LETM1O95202 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LETM1O95202 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LETM1O95202 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LETM1O95202 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LETM1O95202 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LETM1O95202 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LETM1O95202 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LETM1O95202 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LETM1O95202 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LETM1O95202 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LETM1O95202 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LETM1O95202 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LETM1O95202 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LETM1O95202 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LETM1O95202 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LETM1O95202 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LETM1O95202 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LETM1O95202 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LETM1O95202 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LETM1O95202 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LETM1O95202 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LETM1O95202 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LETM1O95202 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LETM1O95202 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LETM1O95202 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LETM1O95202 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LETM1O95202 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LETM1O95202 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LETM1O95202 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LETM1O95202 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LETM1O95202 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LETM1O95202 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LETM1O95202 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LETM1O95202 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LETM1O95202 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LETM1O95202 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LETM1O95202 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LETM1O95202 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LETM1O95202 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LETM1O95202 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LETM1O95202 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LETM1O95202 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LETM1O95202 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LETM1O95202 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LETM1O95202 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LETM1O95202 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LETM1O95202 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LETM1O95202 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LETM1O95202 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LETM1O95202 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms