Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSTN1O94985 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSTN1O94985 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms