Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CIAO1O76071 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CIAO1O76071 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIAO1O76071 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CIAO1O76071 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CIAO1O76071 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CIAO1O76071 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms