Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH16O75452 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH16O75452 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH16O75452 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH16O75452 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH16O75452 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH16O75452 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH16O75452 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH16O75452 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH16O75452 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH16O75452 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH16O75452 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH16O75452 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH16O75452 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH16O75452 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH16O75452 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH16O75452 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RDH16O75452 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH16O75452 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH16O75452 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH16O75452 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH16O75452 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH16O75452 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH16O75452 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH16O75452 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH16O75452 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH16O75452 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH16O75452 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH16O75452 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH16O75452 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH16O75452 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH16O75452 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH16O75452 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH16O75452 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH16O75452 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH16O75452 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH16O75452 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH16O75452 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH16O75452 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH16O75452 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH16O75452 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH16O75452 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH16O75452 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH16O75452 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH16O75452 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH16O75452 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH16O75452 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH16O75452 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH16O75452 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH16O75452 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH16O75452 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH16O75452 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH16O75452 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH16O75452 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH16O75452 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH16O75452 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH16O75452 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH16O75452 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH16O75452 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH16O75452 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH16O75452 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH16O75452 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH16O75452 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH16O75452 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH16O75452 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDH16O75452 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDH16O75452 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH16O75452 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH16O75452 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH16O75452 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH16O75452 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH16O75452 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH16O75452 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH16O75452 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH16O75452 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH16O75452 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms