Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC45O75419 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC45O75419 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC45O75419 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC45O75419 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC45O75419 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC45O75419 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC45O75419 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC45O75419 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC45O75419 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC45O75419 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC45O75419 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC45O75419 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC45O75419 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC45O75419 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC45O75419 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC45O75419 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC45O75419 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC45O75419 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC45O75419 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC45O75419 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC45O75419 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC45O75419 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC45O75419 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC45O75419 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC45O75419 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC45O75419 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC45O75419 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC45O75419 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC45O75419 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC45O75419 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC45O75419 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC45O75419 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC45O75419 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC45O75419 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC45O75419 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC45O75419 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC45O75419 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC45O75419 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC45O75419 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC45O75419 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC45O75419 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC45O75419 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDC45O75419 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC45O75419 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC45O75419 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC45O75419 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC45O75419 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC45O75419 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC45O75419 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC45O75419 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC45O75419 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC45O75419 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC45O75419 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC45O75419 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC45O75419 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC45O75419 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC45O75419 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC45O75419 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC45O75419 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC45O75419 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC45O75419 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC45O75419 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC45O75419 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC45O75419 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC45O75419 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC45O75419 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC45O75419 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC45O75419 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC45O75419 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC45O75419 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC45O75419 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC45O75419 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC45O75419 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC45O75419 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC45O75419 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC45O75419 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDC45O75419 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDC45O75419 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDC45O75419 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC45O75419 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC45O75419 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC45O75419 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC45O75419 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC45O75419 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC45O75419 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC45O75419 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC45O75419 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC45O75419 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC45O75419 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC45O75419 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC45O75419 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC45O75419 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC45O75419 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC45O75419 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC45O75419 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC45O75419 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC45O75419 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC45O75419 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC45O75419 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms