Protein–RNA interactions for Protein: O75351

VPS4B, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4BO75351 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS4BO75351 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS4BO75351 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms