Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF253O75346 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF253O75346 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF253O75346 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF253O75346 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF253O75346 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF253O75346 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF253O75346 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF253O75346 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms