Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED4O75132 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED4O75132 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED4O75132 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ZBED4O75132 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms