Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P1O60361 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME2P1O60361 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME2P1O60361 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms