Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXTL3O43909 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXTL3O43909 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms