Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR3O43761 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR3O43761 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR3O43761 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms