Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BUD23O43709 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BUD23O43709 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BUD23O43709 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BUD23O43709 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BUD23O43709 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BUD23O43709 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BUD23O43709 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BUD23O43709 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BUD23O43709 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BUD23O43709 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BUD23O43709 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BUD23O43709 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BUD23O43709 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BUD23O43709 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BUD23O43709 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BUD23O43709 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BUD23O43709 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BUD23O43709 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BUD23O43709 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BUD23O43709 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BUD23O43709 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BUD23O43709 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BUD23O43709 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BUD23O43709 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BUD23O43709 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BUD23O43709 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BUD23O43709 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BUD23O43709 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BUD23O43709 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BUD23O43709 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BUD23O43709 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BUD23O43709 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BUD23O43709 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BUD23O43709 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BUD23O43709 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BUD23O43709 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BUD23O43709 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BUD23O43709 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BUD23O43709 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BUD23O43709 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BUD23O43709 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BUD23O43709 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BUD23O43709 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BUD23O43709 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BUD23O43709 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BUD23O43709 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BUD23O43709 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BUD23O43709 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BUD23O43709 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BUD23O43709 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BUD23O43709 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BUD23O43709 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BUD23O43709 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BUD23O43709 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BUD23O43709 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BUD23O43709 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BUD23O43709 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BUD23O43709 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BUD23O43709 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BUD23O43709 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BUD23O43709 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BUD23O43709 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BUD23O43709 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BUD23O43709 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BUD23O43709 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BUD23O43709 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BUD23O43709 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BUD23O43709 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BUD23O43709 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BUD23O43709 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BUD23O43709 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BUD23O43709 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BUD23O43709 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BUD23O43709 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BUD23O43709 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BUD23O43709 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BUD23O43709 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BUD23O43709 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BUD23O43709 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BUD23O43709 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BUD23O43709 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BUD23O43709 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BUD23O43709 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BUD23O43709 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BUD23O43709 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BUD23O43709 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BUD23O43709 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms