Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHGDHO43175 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms