Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP8O43159 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP8O43159 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP8O43159 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP8O43159 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP8O43159 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP8O43159 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP8O43159 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP8O43159 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP8O43159 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP8O43159 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP8O43159 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP8O43159 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP8O43159 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP8O43159 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP8O43159 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP8O43159 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP8O43159 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP8O43159 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP8O43159 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP8O43159 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP8O43159 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP8O43159 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP8O43159 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP8O43159 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP8O43159 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP8O43159 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP8O43159 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP8O43159 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP8O43159 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP8O43159 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP8O43159 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP8O43159 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP8O43159 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP8O43159 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP8O43159 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP8O43159 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP8O43159 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP8O43159 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP8O43159 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP8O43159 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP8O43159 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP8O43159 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP8O43159 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP8O43159 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP8O43159 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP8O43159 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP8O43159 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP8O43159 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP8O43159 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP8O43159 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP8O43159 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP8O43159 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP8O43159 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP8O43159 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP8O43159 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP8O43159 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP8O43159 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP8O43159 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP8O43159 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP8O43159 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP8O43159 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP8O43159 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP8O43159 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP8O43159 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP8O43159 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP8O43159 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP8O43159 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP8O43159 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP8O43159 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP8O43159 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP8O43159 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP8O43159 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP8O43159 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP8O43159 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP8O43159 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP8O43159 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP8O43159 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP8O43159 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP8O43159 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP8O43159 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP8O43159 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP8O43159 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP8O43159 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP8O43159 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP8O43159 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP8O43159 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP8O43159 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRP8O43159 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP8O43159 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP8O43159 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP8O43159 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP8O43159 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP8O43159 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP8O43159 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP8O43159 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP8O43159 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP8O43159 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP8O43159 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRP8O43159 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms