Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01565O15544 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC01565O15544 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01565O15544 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms