Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLOCKO15516 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLOCKO15516 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms