Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC16AO15027 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC16AO15027 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms