Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASKO14936 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASKO14936 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASKO14936 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASKO14936 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASKO14936 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASKO14936 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASKO14936 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASKO14936 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASKO14936 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASKO14936 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASKO14936 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASKO14936 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASKO14936 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASKO14936 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASKO14936 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASKO14936 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASKO14936 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASKO14936 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASKO14936 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASKO14936 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASKO14936 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASKO14936 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASKO14936 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASKO14936 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASKO14936 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASKO14936 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASKO14936 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASKO14936 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASKO14936 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASKO14936 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASKO14936 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASKO14936 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASKO14936 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASKO14936 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASKO14936 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASKO14936 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASKO14936 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASKO14936 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASKO14936 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASKO14936 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASKO14936 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASKO14936 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASKO14936 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASKO14936 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASKO14936 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASKO14936 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASKO14936 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CASKO14936 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASKO14936 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASKO14936 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASKO14936 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASKO14936 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASKO14936 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASKO14936 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASKO14936 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASKO14936 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASKO14936 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASKO14936 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASKO14936 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASKO14936 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASKO14936 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASKO14936 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASKO14936 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASKO14936 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASKO14936 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CASKO14936 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASKO14936 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASKO14936 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASKO14936 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASKO14936 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CASKO14936 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASKO14936 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASKO14936 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASKO14936 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASKO14936 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASKO14936 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASKO14936 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASKO14936 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASKO14936 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASKO14936 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASKO14936 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASKO14936 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASKO14936 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASKO14936 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASKO14936 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms