Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DLL1O00548 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DLL1O00548 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DLL1O00548 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DLL1O00548 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DLL1O00548 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DLL1O00548 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DLL1O00548 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL1O00548 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL1O00548 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL1O00548 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL1O00548 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL1O00548 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL1O00548 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL1O00548 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL1O00548 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL1O00548 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL1O00548 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL1O00548 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DLL1O00548 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL1O00548 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL1O00548 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL1O00548 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL1O00548 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DLL1O00548 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL1O00548 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL1O00548 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL1O00548 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL1O00548 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL1O00548 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL1O00548 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL1O00548 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DLL1O00548 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL1O00548 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL1O00548 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL1O00548 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL1O00548 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL1O00548 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL1O00548 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL1O00548 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DLL1O00548 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL1O00548 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL1O00548 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL1O00548 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL1O00548 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL1O00548 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL1O00548 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL1O00548 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL1O00548 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL1O00548 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DLL1O00548 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DLL1O00548 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DLL1O00548 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DLL1O00548 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DLL1O00548 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DLL1O00548 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DLL1O00548 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DLL1O00548 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL1O00548 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL1O00548 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL1O00548 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL1O00548 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DLL1O00548 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL1O00548 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL1O00548 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL1O00548 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL1O00548 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL1O00548 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL1O00548 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLL1O00548 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL1O00548 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL1O00548 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL1O00548 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL1O00548 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL1O00548 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL1O00548 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL1O00548 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL1O00548 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL1O00548 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLL1O00548 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DLL1O00548 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DLL1O00548 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DLL1O00548 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DLL1O00548 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DLL1O00548 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DLL1O00548 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL1O00548 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL1O00548 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL1O00548 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL1O00548 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL1O00548 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL1O00548 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DLL1O00548 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DLL1O00548 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DLL1O00548 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DLL1O00548 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DLL1O00548 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DLL1O00548 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DLL1O00548 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DLL1O00548 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms