Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGRNO00468 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGRNO00468 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGRNO00468 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGRNO00468 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGRNO00468 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGRNO00468 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGRNO00468 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGRNO00468 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGRNO00468 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGRNO00468 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGRNO00468 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGRNO00468 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AGRNO00468 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AGRNO00468 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AGRNO00468 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGRNO00468 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGRNO00468 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGRNO00468 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGRNO00468 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGRNO00468 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGRNO00468 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGRNO00468 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGRNO00468 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGRNO00468 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGRNO00468 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGRNO00468 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AGRNO00468 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AGRNO00468 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AGRNO00468 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AGRNO00468 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AGRNO00468 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AGRNO00468 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AGRNO00468 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AGRNO00468 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AGRNO00468 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AGRNO00468 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AGRNO00468 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AGRNO00468 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AGRNO00468 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AGRNO00468 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AGRNO00468 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AGRNO00468 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AGRNO00468 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AGRNO00468 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AGRNO00468 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AGRNO00468 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AGRNO00468 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGRNO00468 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGRNO00468 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGRNO00468 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGRNO00468 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGRNO00468 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AGRNO00468 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGRNO00468 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGRNO00468 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGRNO00468 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGRNO00468 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
AGRNO00468 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGRNO00468 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGRNO00468 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms