Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPSO00116 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGPSO00116 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPSO00116 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPSO00116 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPSO00116 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPSO00116 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPSO00116 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPSO00116 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPSO00116 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPSO00116 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGPSO00116 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGPSO00116 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGPSO00116 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGPSO00116 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGPSO00116 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPSO00116 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPSO00116 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPSO00116 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGPSO00116 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGPSO00116 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGPSO00116 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGPSO00116 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGPSO00116 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGPSO00116 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGPSO00116 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGPSO00116 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGPSO00116 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGPSO00116 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGPSO00116 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGPSO00116 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGPSO00116 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGPSO00116 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPSO00116 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPSO00116 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPSO00116 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPSO00116 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPSO00116 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPSO00116 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPSO00116 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPSO00116 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPSO00116 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPSO00116 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPSO00116 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPSO00116 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPSO00116 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPSO00116 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPSO00116 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPSO00116 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPSO00116 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPSO00116 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPSO00116 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPSO00116 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPSO00116 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPSO00116 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPSO00116 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPSO00116 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPSO00116 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPSO00116 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPSO00116 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPSO00116 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPSO00116 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGPSO00116 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGPSO00116 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGPSO00116 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AGPSO00116 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGPSO00116 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGPSO00116 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPSO00116 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPSO00116 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPSO00116 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPSO00116 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPSO00116 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPSO00116 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPSO00116 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPSO00116 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGPSO00116 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGPSO00116 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGPSO00116 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGPSO00116 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGPSO00116 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AGPSO00116 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGPSO00116 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPSO00116 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPSO00116 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPSO00116 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPSO00116 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPSO00116 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPSO00116 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPSO00116 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPSO00116 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPSO00116 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPSO00116 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPSO00116 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGPSO00116 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGPSO00116 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGPSO00116 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGPSO00116 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGPSO00116 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGPSO00116 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms