Protein–RNA interactions for Protein: H0YCG3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0YCG3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H0YCG3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H0YCG3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H0YCG3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H0YCG3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H0YCG3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H0YCG3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H0YCG3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H0YCG3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H0YCG3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H0YCG3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H0YCG3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H0YCG3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H0YCG3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H0YCG3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H0YCG3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H0YCG3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H0YCG3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H0YCG3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H0YCG3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H0YCG3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H0YCG3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H0YCG3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H0YCG3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H0YCG3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H0YCG3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H0YCG3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H0YCG3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H0YCG3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H0YCG3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
H0YCG3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H0YCG3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H0YCG3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H0YCG3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H0YCG3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H0YCG3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H0YCG3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H0YCG3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H0YCG3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H0YCG3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H0YCG3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H0YCG3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H0YCG3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H0YCG3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
H0YCG3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H0YCG3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
H0YCG3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H0YCG3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H0YCG3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
H0YCG3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H0YCG3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H0YCG3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H0YCG3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H0YCG3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YCG3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YCG3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YCG3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YCG3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YCG3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YCG3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YCG3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YCG3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YCG3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YCG3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YCG3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YCG3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H0YCG3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H0YCG3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H0YCG3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H0YCG3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H0YCG3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H0YCG3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
H0YCG3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
H0YCG3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
H0YCG3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H0YCG3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H0YCG3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H0YCG3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H0YCG3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H0YCG3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H0YCG3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H0YCG3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H0YCG3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H0YCG3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H0YCG3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H0YCG3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H0YCG3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H0YCG3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H0YCG3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H0YCG3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H0YCG3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H0YCG3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
H0YCG3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H0YCG3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H0YCG3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H0YCG3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H0YCG3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H0YCG3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H0YCG3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H0YCG3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms