Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PBE3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PBE3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PBE3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PBE3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E9PBE3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
E9PBE3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E9PBE3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E9PBE3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E9PBE3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E9PBE3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
E9PBE3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E9PBE3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PBE3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PBE3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PBE3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PBE3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PBE3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E9PBE3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PBE3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PBE3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E9PBE3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PBE3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PBE3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PBE3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E9PBE3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E9PBE3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PBE3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PBE3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PBE3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PBE3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PBE3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PBE3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PBE3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PBE3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PBE3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PBE3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PBE3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PBE3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PBE3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PBE3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PBE3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PBE3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PBE3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PBE3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PBE3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PBE3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PBE3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PBE3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PBE3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E9PBE3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PBE3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PBE3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PBE3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PBE3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PBE3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PBE3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PBE3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PBE3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PBE3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PBE3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E9PBE3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PBE3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PBE3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PBE3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E9PBE3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E9PBE3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PBE3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PBE3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PBE3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PBE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PBE3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PBE3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PBE3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E9PBE3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PBE3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PBE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PBE3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PBE3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PBE3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PBE3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PBE3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PBE3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E9PBE3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms