Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DIRC3C9JPN6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms