Protein–RNA interactions for Protein: B3GLJ2

PATE3, Prostate and testis expressed protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE3B3GLJ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATE3B3GLJ2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATE3B3GLJ2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATE3B3GLJ2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATE3B3GLJ2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATE3B3GLJ2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATE3B3GLJ2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATE3B3GLJ2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATE3B3GLJ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATE3B3GLJ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATE3B3GLJ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PATE3B3GLJ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATE3B3GLJ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PATE3B3GLJ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PATE3B3GLJ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATE3B3GLJ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms