Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VGLL3A8MV65 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VGLL3A8MV65 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms