Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NOTOA8MTQ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms