Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PP2D1A8MPX8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PP2D1A8MPX8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PP2D1A8MPX8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PP2D1A8MPX8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PP2D1A8MPX8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PP2D1A8MPX8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PP2D1A8MPX8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PP2D1A8MPX8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PP2D1A8MPX8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PP2D1A8MPX8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PP2D1A8MPX8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PP2D1A8MPX8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PP2D1A8MPX8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms