Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJE1A6NN92 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJE1A6NN92 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJE1A6NN92 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms