Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW4

LRRC3C, Leucine-rich repeat-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3CA6NJW4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC3CA6NJW4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC3CA6NJW4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms