Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WTIPA6NIX2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
WTIPA6NIX2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
WTIPA6NIX2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
WTIPA6NIX2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
WTIPA6NIX2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WTIPA6NIX2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
WTIPA6NIX2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms