Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC10BA6NIK2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC10BA6NIK2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms