Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC4A6NH21 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SERINC4A6NH21 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERINC4A6NH21 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms