Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
STRCP1A6NGW2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCP1A6NGW2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
STRCP1A6NGW2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
STRCP1A6NGW2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms