Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE2

SMCO2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO2A6NFE2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMCO2A6NFE2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMCO2A6NFE2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMCO2A6NFE2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms