Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM43BA6NCK2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM43BA6NCK2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM43BA6NCK2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43BA6NCK2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms