Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS37CA5D8V6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS37CA5D8V6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37CA5D8V6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 413 ms