Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNP1A1A4G5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNP1A1A4G5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms