Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTL3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTL3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GTL3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A1B0GTL3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTL3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms