Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNN3Q9UGI6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNN3Q9UGI6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNN3Q9UGI6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNN3Q9UGI6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNN3Q9UGI6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNN3Q9UGI6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNN3Q9UGI6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNN3Q9UGI6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNN3Q9UGI6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNN3Q9UGI6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNN3Q9UGI6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNN3Q9UGI6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNN3Q9UGI6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNN3Q9UGI6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNN3Q9UGI6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNN3Q9UGI6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNN3Q9UGI6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNN3Q9UGI6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNN3Q9UGI6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNN3Q9UGI6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNN3Q9UGI6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNN3Q9UGI6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNN3Q9UGI6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNN3Q9UGI6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNN3Q9UGI6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNN3Q9UGI6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNN3Q9UGI6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNN3Q9UGI6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNN3Q9UGI6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNN3Q9UGI6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNN3Q9UGI6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNN3Q9UGI6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNN3Q9UGI6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNN3Q9UGI6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNN3Q9UGI6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNN3Q9UGI6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNN3Q9UGI6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNN3Q9UGI6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNN3Q9UGI6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNN3Q9UGI6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNN3Q9UGI6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNN3Q9UGI6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNN3Q9UGI6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNN3Q9UGI6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNN3Q9UGI6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNN3Q9UGI6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNN3Q9UGI6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNN3Q9UGI6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNN3Q9UGI6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNN3Q9UGI6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNN3Q9UGI6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNN3Q9UGI6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNN3Q9UGI6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNN3Q9UGI6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNN3Q9UGI6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNN3Q9UGI6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNN3Q9UGI6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNN3Q9UGI6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNN3Q9UGI6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNN3Q9UGI6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNN3Q9UGI6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNN3Q9UGI6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNN3Q9UGI6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNN3Q9UGI6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNN3Q9UGI6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNN3Q9UGI6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNN3Q9UGI6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNN3Q9UGI6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNN3Q9UGI6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNN3Q9UGI6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNN3Q9UGI6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNN3Q9UGI6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNN3Q9UGI6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNN3Q9UGI6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNN3Q9UGI6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNN3Q9UGI6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNN3Q9UGI6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNN3Q9UGI6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNN3Q9UGI6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNN3Q9UGI6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNN3Q9UGI6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNN3Q9UGI6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNN3Q9UGI6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNN3Q9UGI6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNN3Q9UGI6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNN3Q9UGI6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms