Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THUMPD1Q9NXG2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THUMPD1Q9NXG2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THUMPD1Q9NXG2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THUMPD1Q9NXG2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THUMPD1Q9NXG2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
THUMPD1Q9NXG2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
THUMPD1Q9NXG2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
THUMPD1Q9NXG2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
THUMPD1Q9NXG2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
THUMPD1Q9NXG2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD1Q9NXG2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD1Q9NXG2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD1Q9NXG2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD1Q9NXG2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THUMPD1Q9NXG2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THUMPD1Q9NXG2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THUMPD1Q9NXG2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THUMPD1Q9NXG2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD1Q9NXG2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
THUMPD1Q9NXG2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD1Q9NXG2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD1Q9NXG2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THUMPD1Q9NXG2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD1Q9NXG2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD1Q9NXG2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD1Q9NXG2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD1Q9NXG2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD1Q9NXG2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD1Q9NXG2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
THUMPD1Q9NXG2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD1Q9NXG2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD1Q9NXG2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD1Q9NXG2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD1Q9NXG2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD1Q9NXG2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD1Q9NXG2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD1Q9NXG2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD1Q9NXG2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD1Q9NXG2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD1Q9NXG2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
THUMPD1Q9NXG2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD1Q9NXG2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THUMPD1Q9NXG2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD1Q9NXG2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD1Q9NXG2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD1Q9NXG2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
THUMPD1Q9NXG2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
THUMPD1Q9NXG2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
THUMPD1Q9NXG2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
THUMPD1Q9NXG2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
THUMPD1Q9NXG2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
THUMPD1Q9NXG2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
THUMPD1Q9NXG2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
THUMPD1Q9NXG2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
THUMPD1Q9NXG2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
THUMPD1Q9NXG2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
THUMPD1Q9NXG2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
THUMPD1Q9NXG2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
THUMPD1Q9NXG2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THUMPD1Q9NXG2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THUMPD1Q9NXG2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THUMPD1Q9NXG2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THUMPD1Q9NXG2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THUMPD1Q9NXG2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THUMPD1Q9NXG2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THUMPD1Q9NXG2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
THUMPD1Q9NXG2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
THUMPD1Q9NXG2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
THUMPD1Q9NXG2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THUMPD1Q9NXG2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
THUMPD1Q9NXG2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
THUMPD1Q9NXG2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
THUMPD1Q9NXG2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
THUMPD1Q9NXG2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
THUMPD1Q9NXG2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
THUMPD1Q9NXG2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
THUMPD1Q9NXG2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
THUMPD1Q9NXG2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
THUMPD1Q9NXG2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
THUMPD1Q9NXG2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD1Q9NXG2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD1Q9NXG2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD1Q9NXG2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD1Q9NXG2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms