Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOD2Q9HC29 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOD2Q9HC29 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NOD2Q9HC29 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NOD2Q9HC29 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NOD2Q9HC29 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NOD2Q9HC29 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NOD2Q9HC29 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NOD2Q9HC29 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NOD2Q9HC29 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NOD2Q9HC29 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOD2Q9HC29 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOD2Q9HC29 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NOD2Q9HC29 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NOD2Q9HC29 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NOD2Q9HC29 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NOD2Q9HC29 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NOD2Q9HC29 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NOD2Q9HC29 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOD2Q9HC29 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOD2Q9HC29 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOD2Q9HC29 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOD2Q9HC29 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NOD2Q9HC29 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NOD2Q9HC29 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NOD2Q9HC29 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NOD2Q9HC29 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NOD2Q9HC29 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NOD2Q9HC29 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOD2Q9HC29 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOD2Q9HC29 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOD2Q9HC29 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOD2Q9HC29 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOD2Q9HC29 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOD2Q9HC29 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NOD2Q9HC29 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOD2Q9HC29 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOD2Q9HC29 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOD2Q9HC29 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NOD2Q9HC29 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NOD2Q9HC29 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NOD2Q9HC29 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOD2Q9HC29 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOD2Q9HC29 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOD2Q9HC29 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOD2Q9HC29 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOD2Q9HC29 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOD2Q9HC29 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NOD2Q9HC29 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NOD2Q9HC29 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NOD2Q9HC29 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOD2Q9HC29 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOD2Q9HC29 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOD2Q9HC29 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NOD2Q9HC29 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOD2Q9HC29 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOD2Q9HC29 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOD2Q9HC29 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOD2Q9HC29 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOD2Q9HC29 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOD2Q9HC29 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOD2Q9HC29 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NOD2Q9HC29 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOD2Q9HC29 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOD2Q9HC29 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOD2Q9HC29 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOD2Q9HC29 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOD2Q9HC29 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOD2Q9HC29 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOD2Q9HC29 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOD2Q9HC29 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOD2Q9HC29 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOD2Q9HC29 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOD2Q9HC29 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOD2Q9HC29 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOD2Q9HC29 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOD2Q9HC29 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOD2Q9HC29 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOD2Q9HC29 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOD2Q9HC29 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOD2Q9HC29 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOD2Q9HC29 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOD2Q9HC29 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOD2Q9HC29 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOD2Q9HC29 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms