Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU1

BARX1, Homeobox protein BarH-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1Q9HBU1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARX1Q9HBU1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARX1Q9HBU1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARX1Q9HBU1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BARX1Q9HBU1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARX1Q9HBU1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARX1Q9HBU1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BARX1Q9HBU1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BARX1Q9HBU1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BARX1Q9HBU1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BARX1Q9HBU1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BARX1Q9HBU1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARX1Q9HBU1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARX1Q9HBU1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARX1Q9HBU1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARX1Q9HBU1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BARX1Q9HBU1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARX1Q9HBU1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BARX1Q9HBU1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARX1Q9HBU1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARX1Q9HBU1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARX1Q9HBU1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BARX1Q9HBU1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BARX1Q9HBU1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARX1Q9HBU1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARX1Q9HBU1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARX1Q9HBU1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARX1Q9HBU1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARX1Q9HBU1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARX1Q9HBU1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BARX1Q9HBU1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BARX1Q9HBU1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BARX1Q9HBU1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BARX1Q9HBU1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BARX1Q9HBU1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BARX1Q9HBU1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARX1Q9HBU1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARX1Q9HBU1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BARX1Q9HBU1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BARX1Q9HBU1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BARX1Q9HBU1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARX1Q9HBU1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BARX1Q9HBU1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARX1Q9HBU1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARX1Q9HBU1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARX1Q9HBU1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX1Q9HBU1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX1Q9HBU1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARX1Q9HBU1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX1Q9HBU1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX1Q9HBU1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX1Q9HBU1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX1Q9HBU1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARX1Q9HBU1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARX1Q9HBU1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARX1Q9HBU1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BARX1Q9HBU1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARX1Q9HBU1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARX1Q9HBU1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARX1Q9HBU1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BARX1Q9HBU1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BARX1Q9HBU1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BARX1Q9HBU1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARX1Q9HBU1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARX1Q9HBU1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARX1Q9HBU1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARX1Q9HBU1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARX1Q9HBU1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARX1Q9HBU1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARX1Q9HBU1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARX1Q9HBU1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARX1Q9HBU1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BARX1Q9HBU1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARX1Q9HBU1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARX1Q9HBU1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BARX1Q9HBU1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BARX1Q9HBU1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BARX1Q9HBU1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARX1Q9HBU1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARX1Q9HBU1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARX1Q9HBU1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARX1Q9HBU1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARX1Q9HBU1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARX1Q9HBU1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARX1Q9HBU1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX1Q9HBU1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARX1Q9HBU1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARX1Q9HBU1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARX1Q9HBU1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARX1Q9HBU1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARX1Q9HBU1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX1Q9HBU1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX1Q9HBU1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX1Q9HBU1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX1Q9HBU1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BARX1Q9HBU1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BARX1Q9HBU1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARX1Q9HBU1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARX1Q9HBU1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARX1Q9HBU1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms