Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARVBQ9HBI1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PARVBQ9HBI1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARVBQ9HBI1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARVBQ9HBI1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARVBQ9HBI1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARVBQ9HBI1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARVBQ9HBI1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PARVBQ9HBI1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PARVBQ9HBI1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARVBQ9HBI1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PARVBQ9HBI1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARVBQ9HBI1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PARVBQ9HBI1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARVBQ9HBI1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PARVBQ9HBI1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARVBQ9HBI1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARVBQ9HBI1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARVBQ9HBI1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARVBQ9HBI1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PARVBQ9HBI1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARVBQ9HBI1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARVBQ9HBI1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARVBQ9HBI1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARVBQ9HBI1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARVBQ9HBI1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARVBQ9HBI1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARVBQ9HBI1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARVBQ9HBI1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARVBQ9HBI1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARVBQ9HBI1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARVBQ9HBI1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARVBQ9HBI1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARVBQ9HBI1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARVBQ9HBI1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARVBQ9HBI1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARVBQ9HBI1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARVBQ9HBI1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARVBQ9HBI1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARVBQ9HBI1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARVBQ9HBI1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARVBQ9HBI1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARVBQ9HBI1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARVBQ9HBI1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PARVBQ9HBI1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARVBQ9HBI1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARVBQ9HBI1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARVBQ9HBI1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARVBQ9HBI1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARVBQ9HBI1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARVBQ9HBI1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARVBQ9HBI1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARVBQ9HBI1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARVBQ9HBI1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARVBQ9HBI1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARVBQ9HBI1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARVBQ9HBI1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARVBQ9HBI1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PARVBQ9HBI1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARVBQ9HBI1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PARVBQ9HBI1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PARVBQ9HBI1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARVBQ9HBI1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PARVBQ9HBI1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARVBQ9HBI1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PARVBQ9HBI1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARVBQ9HBI1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PARVBQ9HBI1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARVBQ9HBI1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARVBQ9HBI1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARVBQ9HBI1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PARVBQ9HBI1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARVBQ9HBI1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARVBQ9HBI1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARVBQ9HBI1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARVBQ9HBI1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARVBQ9HBI1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARVBQ9HBI1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARVBQ9HBI1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARVBQ9HBI1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARVBQ9HBI1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARVBQ9HBI1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARVBQ9HBI1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARVBQ9HBI1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARVBQ9HBI1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARVBQ9HBI1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARVBQ9HBI1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARVBQ9HBI1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms