Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPF2Q9H7B2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPF2Q9H7B2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPF2Q9H7B2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RPF2Q9H7B2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPF2Q9H7B2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPF2Q9H7B2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPF2Q9H7B2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPF2Q9H7B2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPF2Q9H7B2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPF2Q9H7B2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPF2Q9H7B2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPF2Q9H7B2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPF2Q9H7B2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RPF2Q9H7B2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPF2Q9H7B2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPF2Q9H7B2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPF2Q9H7B2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPF2Q9H7B2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPF2Q9H7B2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPF2Q9H7B2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPF2Q9H7B2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RPF2Q9H7B2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPF2Q9H7B2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPF2Q9H7B2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPF2Q9H7B2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPF2Q9H7B2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPF2Q9H7B2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPF2Q9H7B2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPF2Q9H7B2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPF2Q9H7B2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPF2Q9H7B2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPF2Q9H7B2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPF2Q9H7B2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPF2Q9H7B2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPF2Q9H7B2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPF2Q9H7B2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPF2Q9H7B2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPF2Q9H7B2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPF2Q9H7B2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPF2Q9H7B2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPF2Q9H7B2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPF2Q9H7B2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPF2Q9H7B2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPF2Q9H7B2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPF2Q9H7B2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPF2Q9H7B2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPF2Q9H7B2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPF2Q9H7B2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPF2Q9H7B2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPF2Q9H7B2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPF2Q9H7B2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPF2Q9H7B2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPF2Q9H7B2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPF2Q9H7B2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPF2Q9H7B2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPF2Q9H7B2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPF2Q9H7B2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPF2Q9H7B2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPF2Q9H7B2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPF2Q9H7B2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPF2Q9H7B2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPF2Q9H7B2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPF2Q9H7B2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPF2Q9H7B2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPF2Q9H7B2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPF2Q9H7B2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPF2Q9H7B2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPF2Q9H7B2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPF2Q9H7B2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPF2Q9H7B2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPF2Q9H7B2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPF2Q9H7B2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPF2Q9H7B2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPF2Q9H7B2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPF2Q9H7B2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPF2Q9H7B2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPF2Q9H7B2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPF2Q9H7B2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPF2Q9H7B2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPF2Q9H7B2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPF2Q9H7B2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPF2Q9H7B2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPF2Q9H7B2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPF2Q9H7B2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPF2Q9H7B2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPF2Q9H7B2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPF2Q9H7B2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPF2Q9H7B2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RPF2Q9H7B2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPF2Q9H7B2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPF2Q9H7B2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPF2Q9H7B2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPF2Q9H7B2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPF2Q9H7B2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPF2Q9H7B2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPF2Q9H7B2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPF2Q9H7B2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPF2Q9H7B2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPF2Q9H7B2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms